Folikulární punkce je prováděna za pomoci nejmodernějších ultrazvukových přístrojů a téměř výhradně pochvou (= transvaginálně).
Folikuly jsou zobrazeny vaginální sondou a následně je vedena jehla ve směru punkční linie do centra folikulu tak, aby aspirovala folikulární tekutinu s
vajíčkem.
Tento úkon se provádí většinou v lehkém spánku (analgosedace nebo krátkodobá celková anestezie).